二代高通量测序

样本中的微生物一般包括细菌、真菌、古菌、真核微生物等。不同类型微生物检测的基因片段不同。根据检测的基因片段不同,检测服务一般分为扩增子检测宏基因组检测

扩增子检测

扩增子检测服务主要包括6种,细菌(16S rDNA)多样性检测、真菌(ITS)多样性检测、古菌(16S rDNA)多样性检测、真核微生物(18S rDNA)多样性检测、功能基因多样性检测、特定基因片段的检测。

提取DNA后,扩增不同的目的基因片段,利用二代高通量测序平台检测扩增的片段,对测得的序列进行生物信息分析,从而得到微生物的种类和相对丰度。

对于扩增子检测,在人体和环境方面研究都十分火热。其中在人体方面,肠道菌群研究的十分火热;在环境方面,土壤、水体等微生物项目研究的较多。我们将专门开辟新的栏目来对这两方面进行介绍。

gut microbiome

人体微生态

soil (2)

环境微生态

宏基因组检测

宏基因组检测一般是对样本全部的微生物进行检测。提取DNA后,对全部DNA进行随机打断,利用二代高通量测序平台检测全部的DNA,对测得的序列进行生物信息分析,从而得到全部微生物的种类和相对丰度。

meta

                   宏基因组


 
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