真核微生物18S rDNA检测

在真核微生物中有三类核糖体RNA(rRNA),包括5.8S rRNA、18S rRNA和28S rRNA。

18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,反映样品中真核生物之间的种类差异。在18S rDNA中既有保守区,也有可变区。保守区域反映了生物物种间的亲缘关系,而可变区则能体现物种间的差异。目前文献中,V4区用的最多,且其数据库信息最全、分类效果最好,是18S rRNA基因分析注释的最佳选择。

技术路线

technology line for 16S

数据分析内容

生物信息分析内容
基础分析 常规分析 高级分析
有效序列统计 热图 相关性分析
稀释性曲线 Venn图 网络图分析
OTU聚类注释格 PCA分析
α多样性指数 PCoA分析
物种信息汇总表 RDA/CCA分析
物种柱状图 LefSe分析
热图 组间差异分析

样本类型

环境样本:土壤、水体、空气、活性淤泥、根系、叶片、植物体等

人体样本:粪便、唾液、皮肤、生殖道、组织等

动物样本:粪便、内容物、组织等

更多信息请查阅“微生物多样性检测送样要求”


 
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