菌种鉴定

利用分子生物学技术,通过一代测序技术,对微生物的DNA进行测序。DNA测序不依赖菌种本身特点,对所有菌种均可使用。与传统生化鉴定相比,该菌种鉴定的方法更加快速,准确。

公司提供的微生物物种鉴定服务包括细菌16s rDNA鉴定和真菌ITS鉴定,通过PCR扩增16S rDNA或ITS片段,通过一代测序检测扩增的基因片段。之后与NCBI数据库进行BLAST比对,统计相似性最高的前10位的物种信息并构建系统发育树。

服务内容

鉴定类型 检测基因 服务周期
1 细菌 16S 15个工作日
2 真菌 ITS 15个工作日
3 真核微生物 18S 15个工作日

技术路线

16S-one

样本和寄送要求

1、提供的检测样本需为纯菌,样品形式可以是新鲜菌液、斜面培养基、平面培养基或者提取好的DNA。
2、如果样品为基因组DNA,DNA浓度>20ng/ul,体积大于20ul。
3、样本寄送时,需保持4℃环境,请采用泡沫盒+冰袋进行运输。
4、由于快递比较暴力,建议不要寄送玻璃器皿。请将在玻璃器皿的菌株转移到塑料器皿内,再进行寄送。具体处理方法请参照“菌种鉴定样本处理方法”。

结果说明

在报告中包括实验过程描述、PCR产物照片、序列碱基报告、Blast序列比对结果和系统发育树。
具体内容请参照的“菌种鉴定报告模板”。

其他说明

1、鉴定结果主要取决于微生物数据库已知的微生物信息。大多情况下,都可以匹配到最相似的已知菌株。但个别菌种特别是新的物种由于数据库缺乏相关数据,只能匹配到属或科。如遇这种情况,正常收费。
2、若提供的样本为混合菌,不是纯菌时,测序时会出现套峰和杂峰,无法得出正确的测序结果。如遇这种情况,正常收费。
3、限于实验室生物安全条件,本实验室不接受有致病性或传染性的样品。


 
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