真菌ITS检测

ITS（Internally Transcribed Spacer）是内源转录间隔区，位于真菌18S、5.8S和28S rRNA基因之间，分别为ITS 1和ITS 2。

在核糖体DNA中，5.8S、18S和28S rRNA基因在大多数生物中趋于保守，在生物种间变化小，而ITS1和ITS2作为非编码区，承受的选择压力较小，相对变化较大，能够容忍更多的变异，在绝大多数真核生物中表现出极为广泛的序列多态性。

在进化过程中同时，ITS的保守型表现为种内相对一致，种间差异较明显，能够反映出种属间，甚至菌株间的差异。并且ITS序列片段较小（ITS 1和ITS 2长度分别为350 bp和400 bp），易于分析，目前已被广泛用于真菌不同种属的系统发育分析。

真菌的ITS检测，主要是对样本中真菌的多样性进行分析。提取样本的DNA后，扩增ITS，之后利用二代高通量测序仪对扩增的ITS进行测序，经过生物信息分析后，得到样本中真菌的种类和相对丰度。

技术路线

数据分析内容

样本类型

环境样本：土壤、水体、空气、活性淤泥、根系、叶片、植物体等

人体样本：粪便、唾液、皮肤、生殖道、组织等

动物样本：粪便、内容物、组织等

更多信息请查阅“微生物多样性检测送样要求”。