菌种鉴定
利用分子生物学技术,通过一代测序技术,对微生物的DNA进行测序。DNA测序不依赖菌种本身特点,对所有菌种均可使用。与传统生化鉴定相比,该菌种鉴定的方法更加快速,准确。
公司提供的微生物物种鉴定服务包括细菌16s rDNA鉴定和真菌ITS鉴定,通过PCR扩增16S rDNA或ITS片段,通过一代测序检测扩增的基因片段。之后与NCBI数据库进行BLAST比对,统计相似性最高的前10位的物种信息并构建系统发育树。
服务内容
鉴定类型 | 检测基因 | 服务周期 | |
---|---|---|---|
1 | 细菌 | 16S | 15个工作日 |
2 | 真菌 | ITS | 15个工作日 |
3 | 真核微生物 | 18S | 15个工作日 |
技术路线

样本和寄送要求
1、提供的检测样本需为纯菌,样品形式可以是新鲜菌液、斜面培养基、平面培养基或者提取好的DNA。
2、如果样品为基因组DNA,DNA浓度>20ng/ul,体积大于20ul。
3、样本寄送时,需保持4℃环境,请采用泡沫盒+冰袋进行运输。
4、由于快递比较暴力,建议不要寄送玻璃器皿。请将在玻璃器皿的菌株转移到塑料器皿内,再进行寄送。具体处理方法请参照“菌种鉴定样本处理方法”。
结果说明
在报告中包括实验过程描述、PCR产物照片、序列碱基报告、Blast序列比对结果和系统发育树。
具体内容请参照的“菌种鉴定报告模板”。
其他说明
1、鉴定结果主要取决于微生物数据库已知的微生物信息。大多情况下,都可以匹配到最相似的已知菌株。但个别菌种特别是新的物种由于数据库缺乏相关数据,只能匹配到属或科。如遇这种情况,正常收费。
2、若提供的样本为混合菌,不是纯菌时,测序时会出现套峰和杂峰,无法得出正确的测序结果。如遇这种情况,正常收费。
3、限于实验室生物安全条件,本实验室不接受有致病性或传染性的样品。